1. Quy định về nộp, xác nhận và sử dụng các chứng từ thuộc hồ sơ hải quan, hồ sơ thuế
2. Tổ chức, cá nhân tham gia khai hải quan qua Hệ thống phải đáp ứng các điều kiện (Tổ chức, cá nhân được sử dụng tài khoản VNeID để đăng ký tham gia kết nối với Hệ thống).
3. Hồ sơ xác định trước mã số, trị giá hải quan; Hồ sơ hải quan khi làm thủ tục hải quan; Lưu giữ hồ sơ hải quan đối với hàng hóa xuất khẩu, nhập khẩu.
4. Khai hải quan (áp dụng khi triển khai hải quan số); Đăng ký tờ khai hải quan; Khai bổ sung hồ sơ hải quan hàng hóa xuất khẩu, nhập khẩu. Khai thay đổi mục đích sử dụng bằng hình thức tái xuất. Hủy tờ khai hải quan.
5. Kiểm tra tên hàng, mã số hàng hóa, mức thuế, đơn vị tính; Kiểm tra trị giá hải quan trong quá trình làm thủ tục hải quan; Kiểm tra giấy phép xuất khẩu, giấy phép nhập khẩu, kết quả kiểm tra chuyên ngành; Kiểm tra thực tế hàng hóa.
6. Lấy mẫu, lưu mẫu hàng hóa xuất khẩu, nhập khẩu; Đưa hàng về bảo quản.
7. Thuế tự vệ, thuế chống bán phá giá, thuế chống trợ cấp
8. Quy định chung về hàng hoá vận chuyển chịu sự giám sát hải quan; Thủ tục hải quan đối với hàng hoá vận chuyển chịu sự giám sát hải quan thực hiện thủ tục hải quan theo hình thức vận chuyển độc lập; Thủ tục hải quan đối với hàng hoá quá cảnh; Thủ tục hải quan đối với hàng hoá trung chuyển tại cảng biển.
9. Giám sát hải quan đối với hàng hóa NK đưa vào, lưu giữ, đưa ra cảng, kho, bãi, địa điểm có kết nối Hệ thống xử lý dữ liệu điện tử hải quan; Giám sát hải quan đối với hàng hóa xuất khẩu đưa vào, lưu giữ, đưa ra khu vực cảng, kho, bãi, địa điểm đã có kết nối Hệ thống xử lý dữ liệu điện tử hải quan; Giám sát hải quan đối với các trường hợp khác.
10. Thủ tục hải quan; kiểm tra, giám sát hải quan đối với hàng hóa gia công cho thương nhân nước ngoài; hàng hóa là nguyên liệu, vật tư nhập khẩu để sản xuất hàng xuất khẩu; hàng hóa xuất khẩu, nhập khẩu của doanh nghiệp chế xuất.
11. Thủ tục hải quan đối với hàng hóa xuất nhập khẩu tại chỗ. Thủ tục từ chối nhận hàng.
12. Hướng dẫn lập và kiểm tra Báo cáo quyết toán theo quy định tại Thông tư số 121/2025/TT-BTC